[ONT新知] 利用Nanopore技術在低片段數時來偵測甲基化DNA是一種快速且可信度高的方法

Nanopore定序可使用原本的DNA做定序，可解決利用亞硫酸鹽修飾DNA錯誤的可能與短片段定序無法鑑別重複率以及高度相似的DNA片段的問題。
甲基化DNA微陣列晶片與亞硫酸鹽定序是常見研究人類甲基化的CpG的方法，但是鑒於利用亞硫酸鹽修飾DNA錯誤的可能與短片段定序無法鑑別重複率以及高度相似的DNA片段，Nanopore定序可使用原本的DNA做定序，可解決上述問題。
本篇作者利用10倍覆蓋率的Nanopore定序結果與illumina的450K甲基化DNA微陣列晶片做比較，發現最少5個序列就能達到大於0.89相似度的結果，此篇證明利用Nanopore技術在低片段數時來偵測甲基化DNA是一種快速且可信度高的方法。
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