Nanopore sequencing

DNA 基因

全台首家

Oxford Nanopore

認證的服務供應商

gene book
Nanopore為最新三代定序,具有長序列片段 (long reads)定序的特色,
其可讀取的序列片段可高達20kbp以上,遠高於其他二代序列片段讀取平台的600bp。
  • De novo assembly and Hybrid assembly

    解決NGS法分析之大斷變異重複區域,並適用於研究單倍型鑑定。

  • RNA-seq

    明確鑑定splice variants & fusion transcripts

  • Metagenome analysis

    分析全基因體或片段全長以提高物種鑰定的精確度

Long Reads Sequencing Improves

    Metagenome analysis

  • 分析全基因體或片段全長以提高物種鑑定的精確度
基因檢測報告
基因 檢測
疾病篩檢

    De novo assembly and Hybrid assembly

  • 解決NGS無法分析之大片斷變異和重複區域,並適用於研究單倍型鑑定。
基因 報告
基因 篩檢

    RNA-seq

  • 明確鑑定splice variants&fusion transcripts
DNA 簡社

    Resequencing / Amplicon-sequencing

DNA 疾病
gene 篩檢

Comprehensive Bioinformatics Solutions

1 Basecalling

Convert raw signals into nucleotide sequeces with deep learning algorithms

2 Pre-processing

Demultiplexing
Statistics summary
Quality control
Reads filtering

3 Objective analysis

De novo / hybrid assembly Structural variation detection Microbiome profiling Transcriptomics analysis

4 Advanced analysis

Functional analysisClustering analysis Comparative genomics Network constructionResults VISUALIZATION

大幅改善各種大小基因組的組裝

基因 報告書

2-330

plasmids

質體

檢測 基因

5.7

paenibacillus pasadenensis

類芽孢桿菌科

基因 檢體

12

Saccharomyces cerevisiae

釀酒酵母

檢體 DNA

100

Caenorhabditis elegans

秀麗隱杆線蟲

篩檢 基因

300

Tectona grandis L.f.

柚木

DNA 報告

800

Amphiprion ocellaris

小丑魚

基因 報告

3

Homo Sapien

人類

目標基因序列全長定序

基因 分析

全長轉錄本分析
明確鑑定splice variants & fusion transcripts
低GC偏差,達到 95%覆蓋率

生物基因

Full-length bacterial 16S rRNA
Shotgun metagenomics

基因檢測

HLA haplotyping
any type of DNA amplicon...

服務流程

生物 基因
聯絡康健
基因 檢體
確認實驗規格
基因 分析
樣品寄送
生物DNA
樣品QC確認
基因書
第三代定序
基因 體質
生物資訊分析
基因診斷
完整的分析報告

主要服務規格

編號 實驗項目規格 檢體類別 總量 濃度 OD260/280 OD260/230 RIN
ONT-1 bacteria genome (1-7Mb)
(ligation, 1Gb output)
DNA >3ug >30 ng/μl 1.8-2.2 2.0-2.2 -
ONT-2 genome (7-14Mb)
(ligation, 1.5Gb output)
DNA >3ug >30 ng/μl 1.8-2.2 2.0-2.2 -
ONT-3 metagenome (shotgun) DNA >3ug >30 ng/μl 1.8-2.2 2.0-2.2 -
ONT-4 16S full length sequencing DNA >1ug >30 ng/μl 1.8-2.2 2.0-2.2 -
ONT-5 RNA定序 (cDNA-PCR) (7M output) Total RNA >1ug >30 ng/μl 2.0-2.2 2.0-2.2 >7.0
ONT-6 RNA定序 (cDNA-PCR) (1M output)
Poly(A)RNA >1ug >60 ng/μl 2.0-2.2 2.0-2.2 >7.0

更多定序產品資訊請見Nanopore原廠官網:https://nanoporetech.com/applications/dna-nanopore-sequencing

科研分析的範例報告

16S Anaysis

GenomeAssembly_nanopore Analysis

dRNA_ Nanopore analysis