Short turnaround time of seven to nine hours from sample collection until informed decision for sepsis treatment using nanopore sequencing
敗血症通常由細菌進入血液引起，是危急到生命安全的緊急醫療狀況，及時且準確地使用抗生素對於減少死亡率和抗生素抗藥性至關重要。傳統的血液培養需要長達24-72小時的孵育時間以確定病原體及其對抗生素的敏感性和抗藥性，進而延遲適當藥物的治療。這項研究通過縮短孵育時間和ONT定序的方式，探索減少敗血症診斷等待時間的潛力。
研究中將九種與敗血症相關的臨床細菌分離物注入健康且新鮮的血液樣本中，進行 BD BACTEC™ 血液培養，隨後進行ONT定序以檢測病原體和抗藥性基因（ARGs）。研究發現，在標準實驗室培養箱中僅需 2 小時即可準確識別細菌和檢測 ARGs，從採集樣本、樣本孵育、文庫製備、ONT定序到識別細菌及抗生素抗藥性資料，整個過程僅需 7 至 9 小時。這種方法未來可能在診斷敗血症時大幅縮短檢測時間，對抗生素抗藥性有重要意義，並有潛在的臨床應用價值。
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