[ONT新知] 使用Nanopore分析系統鑑定跨亞型重組基因HIV-1、雙重感染HIV-1的全長基因組結構

人類免疫缺乏病毒1型(HIV-1)具有高遺傳多樣性的特性，例如常以基因重組型態出現。過去對於基因重組之HIV-1的常規檢驗需要進行cloning、單基因組擴增 (single-genome amplification) 等前處理，才能將雙重或多重感染變異體區分開來，過程費時又費力。本篇文獻作者利用Nanopore定序平台建構新的分析系統，針對HIV-1全長或兩段半長基因的擴增子(amplicon) 進行分析以獲得亞型間基因重組或雙重感染HIV-1變異體獨特的遺傳訊息碎片。
這個新的分析系統可以把分析結果的錯誤率降低至0.06%。作者表示這個新的Nanopore sequencing分析系統適用於鑑定跨亞型重組基因HIV-1、雙重感染HIV-1的全長基因組結構，有助於加快 HIV-1 的全長基因組分析和分子流行病學監測，以及協助臨床環境中 HIV-1 耐藥性的基因型測試。
參考來源：https://reurl.cc/oZVyeQ