成本不到 ＄5000 ！單片的MinION Flow cell定序分析黑木蟻（Camponotus pennsylvanicus）數據總產出20 Gb，總成本為1047 美元，其中還包括消耗性試劑。加上設備的固定成本，螞蟻大小的基因組總成本不到 5000 美元！且所有分析使用電腦上平均在 1 週內即可完成。
黑木蟻（Camponotus pennsylvanicus）是一種廣泛分佈於北美的害蟲物種。本篇作者利用nanopore長片段定序，定序深度60X並組裝出206Mb基因組，其BUSCO評分為97.0%，優於其餘的螞蟻組裝。這些數據還包含寄生與共生基因組，一個完整的Wolbachia細菌組裝體，大小為1.2Mb，以及Blochmannia pennsylvanicus共生體大小為791kb。
所有數據皆來自單片的MinION Flow cell產出，數據總產出20 Gb，總成本為1047 美元，其中還包括消耗性試劑。加上設備的固定成本，螞蟻大小的基因組總成本不到 5000 美元！且所有分析使用電腦上平均在 1 週內即可完成。
參考資料: https://academic.oup.com/....../nar/gkac510/6611042......
Recent Posts
2023-11-13
[ONT新知]TISCC-seq方法
2023-01-13