本篇文獻研究使用了一種名為TISCC-seq的多功能方法,它利用基因編輯器引入特定的癌症突變,然後使用單細胞定序技術來確定這些突變的基因型和表現型。TISCC-seq的方法解決了傳統的短讀長單細胞或批量CRISPR篩選方法的一些問題,這兩種方法都無法確認編輯工程引入細胞基因組中的內源性DNA變異。TISCC-seq結合了長讀長和短讀長定序技術,因此可以直接確認CRISPR基因編輯器引入的內源性遺傳變異,並觀察其對基因表達的影響。這項研究能夠在單個細胞水平上評估TP53基因的突變對細胞的功能造成的影響。

此外,研究還展示了TISCC-seq方法對較長基因的適用性,因此可以用於更廣泛的基因組背景中評估遺傳變異。儘管單細胞RNA序列的敏感度有限,但隨著技術的不斷改進,TISCC-seq方法的效率可以提高,這有望擴展其應用範圍。TISCC-seq方法有望用於高效率地評估癌症突變和生殖細胞變異的功能,並提供了一種更精確評估CRISPR篩選結果的可能性。

參考文獻:https://www.nature.com/articles/s41587-023-01949-8