乳牛炎主要由細菌感染,因此快速鑑定乳牛炎的病原菌對於抗生素治療至關重要。16S rRNA是一種成熟有效的診斷細菌感染的方法。此篇研究利用16S rRNA nanopore sequencing評估快速鑑定乳牛炎致病菌的可行性。研究人員從122頭疑似患有乳牛炎的牛的乳汁樣品中萃取 DNA,並使用nanopore平台進行 16S rRNA 定序,與傳統培養方法進行比較來驗證細菌鑑定。nanopore平台從樣品收集到結果出來大約6小時內即可以高準確率鑑定出病原菌,且檢測到乳牛炎的主要致病菌(大腸桿菌、乳房炎鏈球菌、肺炎克雷伯菌和金黃色葡萄球菌)有98.3% 的結果與傳統培養方法鑑定的結果一致。此篇研究表示,nanopore平台可快速準確地診斷乳牛炎病原菌。

參考文獻:https://www.sciencedirect.com/....../pii/S003452882300173X