目前已知植物品種有40多萬種,但90%農地所種植的植物品種卻只有20種之多,加上氣候變遷人口持續增加,未來勢必有糧食危機,因此植物基因組研究的重要性已被廣泛認定。
雖然如此,但對於已知植物品種的基因定序卻很少(僅400種已定序過約佔已知品種的0.1%),原因是植物基因組大小極為多樣化範圍從61Mb 目前已知植物品種有40多萬種,但90%農地所種植的植物品種卻只有20種之多,加上氣候變遷人口持續增加,未來勢必有糧食危機,因此植物基因組研究的重要性已被廣泛認定。 雖然如此,但對於已知植物品種的基因定序卻很少(僅400種已定序過約佔已知品種的0.1%),原因是植物基因組大小極為多樣化範圍從61Mb (例:Genlisea tuberosa)到152Gb(例:Paris japonica),如此大的基因組很難使用傳統短片段定序進行基因體研究。 以下整理了奈米孔定序技術在植物基因組研究的優勢:
  • 讓大型基因組定序變得簡單
  • 解決重複區域和結構變異
  • 可擴展的定序-從實驗室到野外
  • RNA定序,轉錄組學和基因註釋
  • 直接分析的潛力

奈米孔定序提供了大小極為多樣化的植物基因組研究一個很好的平台與方法。
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