過去一兩年,可攜式/移動式定序設備已在不同的傳染病發生地證明了它們確實可用來作為這些病原的現場監測工具。
但當時這些研究囿於原始資料的傳輸、大量資料庫的比對以及對計算硬體設施的要求等因素,使得想要透過即時性分析來有效阻斷疾病的傳播這個目標仍有不少限制。
再來,由於缺乏針對病毒的疫苗資訊,現場就算有了即時分析所得到的病毒序列,也很難馬上找到對應的疫苗。
因此為了有效地解決這樣的需求,以便後續發展大流行前流感疫苗株,美國的團隊利用奈米孔定序設備,設計一個可移動式流感病毒監測及分析平台--Mia (Mobile Influenza Analysis) ,在種豬展覽的會場現場跨夜採樣、定序及分析。而他們從打開這個移動實驗室包到產生組裝好的完整病毒序列及分析僅僅花了不到18個小時。這個嘗試也說明了在傳染病爆發的監測場景中,使用奈米孔定序設備確實可以有效地縮短整個分析的時程。
https://msphere.asm.org/content/5/1/e00822-19
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Nanopore sequencing 可攜式/移動式定序設備作為這些病原的現場監測工具
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